2010/07/24 (Sat) ねこでもできるfMRI解析その１１～さっくり部位を判定編

前回、AALというツールがうまいこと使えなかったので、別のやつを試してみる。
その名もTalairach Clientというもの。
名前のとーりタライラッハ座標をいれたら場所を教えてくれるらしい。
SPMはMNI座標なので変換が必要になるわけですが。
（AALだったら変換いらなかったのに・・・何がだめなのか？）
変換式については
azcog.blog.shinobi.jp/Entry/126/
に書いてあるので忘れたらそれを参照すること→自分

とりあえずまずはだうんろーど。
www.talairach.org/client.html
からさくさくっとな。

Download Mac
Download PC
Download Other
という３種類があるので、とりあえずDownload PCからおとしてみる。
ZIPがおちてくるのでさくっと解凍。

そーすっとHow to Install TalairachClient.txtってのがあるので開いてみる。
How To Install TalairachClient on Windows XPって書き出しのやけにシンプルなテキストだ。
なになに。
Shortcut to TalairachClientというショートカットアイコンを、Shortcut to Program Filesってフォルダにぶっこめ。
…あのこれショートカットの作り方であってインストールのしかたじゃないんですけど…
そいや解説にもJavaで作ったよーとか言ってるから特にインストールとかいらないんじゃね？
うあああまじめに読んで実行しようとして損したああああ。

気を取り直して、TalairachClientってフォルダんなかのTalairachClient.exeって実行ファイルを実行する。
そしたらいかにもJavaな画面が出てくるので「やっぱJavaなんじゃん！」とひとしきり脱力する。
もっかい気を取り直す。
まんなかにSingle Coordinate Searchってのがあって、このXとYとZのとこに調べたいタライラッハ座標うちこむと、下の空欄のとこにそれがどこの部位に相当するか表示されます。
めっさシンプルやん。

上にはDatabase Search Optionsっていうのがあって、そこのSingle Pointってーとこをぽちっとしておくと、うちこんだ座標まさにその場所がどこの部位かを出してくれます。
となりのNearest Gray Matterというのをぽちっとくと、その座標から一番近い灰白質の部位を出してくれるそうです。ノーマライズやスムージングでびみょーにずれたりしてうっかり白質のへんな部位が出たときなんかにつかえるってことでしょう。
Cube Rangeってのをぽちると、何ミリか幅で、その座標を中心とした領域にどんな部位が含まれるかをざっと出してくれます。

下のFrom fileってとこで、座標をざーっと書いてあるファイルを読み込んでざーっと部位出すことも可能らしいです。

ちゃんちゃん♪

…シンプルだ。
すっげーシンプルだ。

あ。
www.talairach.org/
に、Referenceつけてねーってのがあるから忘れず引用しよー。
注意点はそんぐらいか。


エラーはかないのでとりあえずこれでしばらくやってみます。
エラーはきっぱはくやしいので、AALについても折を見て調べてみますけども。