2010/01/16 (Sat) ねこでもできるfMRI解析その４～便利ツール編

だんだん「ねこでもできる」部分に不安が募ってきた。
一回でもエラーはいたらマニュアルどおりにすすまへんやんけ（あたりまえ）。

まあ実際に解析するわたしがねこあたまなので、わたしがみごと解析ロードを完走できたら看板に偽りなし、となるであろ。
…完走できなかったら……どうなるんでしょうね………

いやいや。
がんばればなんとかなるはずだ。


とりあえず今回は、SPMで解析するにあたって必要そうなものを列挙しとく。
列挙するだけで使うのはあとまわし。
まあちゃんと使ったらつかいかたと使用感でも書きます。

・MarsBaR
marsbar.sourceforge.net/
ROI解析に便利などうぐ。
薦められたけどまだ見てない。

・WFU_PickAtlas
www.fmri.wfubmc.edu/cms/software#PickAtlas
タライラッハかMNIでマスクかけたりブロードマンエリアにわけたりできるらしい。
まああとでみる。

SPMはMNIベースだから、MNI→タライラッハの変換が必要だよー、と言われて、上のツールでさくさくやってもいいのだけど、いちおうどんな式かと見てみたら意外とあっさり。
imaging.mrc-cbu.cam.ac.uk/imaging/MniTalairach
これによると、

（タライラッハのX座標) = 0.88*（MNIのX座標）- 0.8
（タライラッハのY座標) = 0.97* （MNIのY座標）- 3.32
（タライラッハのZ座標) = 0.05*（MNIのY座標） + 0.88* （MNIのZ座標）- 0.44

らしい。
こんなんだったら変換プログラムわたしでも組めそうな気がするが。
でも今悠長にプログラミング勉強してる暇ないしなあ。
今の実験がひとだんらくしたらいろいろやってみるのもありかもしれない。